Protein–RNA interactions for Protein: P49821

NDUFV1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV1P49821 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NDUFV1P49821 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NDUFV1P49821 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NDUFV1P49821 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NDUFV1P49821 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NDUFV1P49821 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NDUFV1P49821 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NDUFV1P49821 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NDUFV1P49821 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NDUFV1P49821 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NDUFV1P49821 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NDUFV1P49821 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NDUFV1P49821 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NDUFV1P49821 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NDUFV1P49821 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NDUFV1P49821 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NDUFV1P49821 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NDUFV1P49821 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NDUFV1P49821 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NDUFV1P49821 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NDUFV1P49821 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NDUFV1P49821 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NDUFV1P49821 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NDUFV1P49821 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NDUFV1P49821 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NDUFV1P49821 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NDUFV1P49821 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NDUFV1P49821 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NDUFV1P49821 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NDUFV1P49821 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NDUFV1P49821 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NDUFV1P49821 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms