Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RBM25P49756 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RBM25P49756 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RBM25P49756 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RBM25P49756 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RBM25P49756 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RBM25P49756 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RBM25P49756 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RBM25P49756 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RBM25P49756 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RBM25P49756 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RBM25P49756 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RBM25P49756 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RBM25P49756 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RBM25P49756 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RBM25P49756 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RBM25P49756 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RBM25P49756 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RBM25P49756 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RBM25P49756 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RBM25P49756 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RBM25P49756 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RBM25P49756 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RBM25P49756 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RBM25P49756 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RBM25P49756 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RBM25P49756 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RBM25P49756 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RBM25P49756 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RBM25P49756 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RBM25P49756 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RBM25P49756 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RBM25P49756 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RBM25P49756 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RBM25P49756 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RBM25P49756 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RBM25P49756 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RBM25P49756 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RBM25P49756 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RBM25P49756 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RBM25P49756 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RBM25P49756 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RBM25P49756 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RBM25P49756 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RBM25P49756 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RBM25P49756 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RBM25P49756 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RBM25P49756 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RBM25P49756 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RBM25P49756 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RBM25P49756 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RBM25P49756 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RBM25P49756 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RBM25P49756 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RBM25P49756 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RBM25P49756 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RBM25P49756 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RBM25P49756 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
RBM25P49756 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RBM25P49756 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RBM25P49756 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RBM25P49756 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RBM25P49756 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RBM25P49756 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RBM25P49756 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RBM25P49756 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RBM25P49756 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
RBM25P49756 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBM25P49756 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
RBM25P49756 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBM25P49756 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBM25P49756 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBM25P49756 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBM25P49756 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBM25P49756 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBM25P49756 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBM25P49756 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RBM25P49756 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RBM25P49756 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RBM25P49756 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RBM25P49756 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM25P49756 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM25P49756 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM25P49756 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM25P49756 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM25P49756 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RBM25P49756 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RBM25P49756 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RBM25P49756 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RBM25P49756 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RBM25P49756 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RBM25P49756 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RBM25P49756 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RBM25P49756 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RBM25P49756 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RBM25P49756 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM25P49756 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM25P49756 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM25P49756 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM25P49756 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms