Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
USP5P45974 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
USP5P45974 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USP5P45974 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP5P45974 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP5P45974 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP5P45974 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP5P45974 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USP5P45974 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP5P45974 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP5P45974 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
USP5P45974 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP5P45974 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP5P45974 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP5P45974 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP5P45974 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP5P45974 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP5P45974 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP5P45974 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP5P45974 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP5P45974 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP5P45974 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP5P45974 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
USP5P45974 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP5P45974 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP5P45974 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
USP5P45974 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP5P45974 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP5P45974 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP5P45974 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP5P45974 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP5P45974 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
USP5P45974 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
USP5P45974 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
USP5P45974 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
USP5P45974 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
USP5P45974 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
USP5P45974 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
USP5P45974 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
USP5P45974 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
USP5P45974 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
USP5P45974 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
USP5P45974 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
USP5P45974 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
USP5P45974 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
USP5P45974 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
USP5P45974 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
USP5P45974 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
USP5P45974 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
USP5P45974 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
USP5P45974 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
USP5P45974 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
USP5P45974 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
USP5P45974 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
USP5P45974 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
USP5P45974 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
USP5P45974 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
USP5P45974 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
USP5P45974 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
USP5P45974 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
USP5P45974 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
USP5P45974 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
USP5P45974 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
USP5P45974 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
USP5P45974 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
USP5P45974 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
USP5P45974 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
USP5P45974 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
USP5P45974 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
USP5P45974 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
USP5P45974 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
USP5P45974 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
USP5P45974 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
USP5P45974 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
USP5P45974 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
USP5P45974 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
USP5P45974 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
USP5P45974 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
USP5P45974 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
USP5P45974 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP5P45974 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP5P45974 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP5P45974 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
USP5P45974 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
USP5P45974 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
USP5P45974 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
USP5P45974 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
USP5P45974 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
USP5P45974 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP5P45974 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP5P45974 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP5P45974 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP5P45974 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
USP5P45974 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
USP5P45974 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
USP5P45974 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
USP5P45974 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
USP5P45974 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
USP5P45974 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP5P45974 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms