Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNNT3P45378 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNT3P45378 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNT3P45378 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNT3P45378 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT3P45378 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNT3P45378 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNNT3P45378 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms