Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ITGAEP38570 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ITGAEP38570 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ITGAEP38570 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ITGAEP38570 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.07
ITGAEP38570 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ITGAEP38570 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ITGAEP38570 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ITGAEP38570 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ITGAEP38570 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ITGAEP38570 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ITGAEP38570 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ITGAEP38570 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
ITGAEP38570 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ITGAEP38570 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ITGAEP38570 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ITGAEP38570 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ITGAEP38570 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ITGAEP38570 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ITGAEP38570 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ITGAEP38570 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ITGAEP38570 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ITGAEP38570 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ITGAEP38570 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ITGAEP38570 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
ITGAEP38570 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms