Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62P37198 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP62P37198 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62P37198 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62P37198 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62P37198 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62P37198 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62P37198 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP62P37198 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP62P37198 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62P37198 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP62P37198 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62P37198 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62P37198 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62P37198 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP62P37198 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62P37198 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62P37198 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62P37198 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62P37198 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP62P37198 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP62P37198 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP62P37198 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP62P37198 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62P37198 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62P37198 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62P37198 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62P37198 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP62P37198 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP62P37198 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP62P37198 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP62P37198 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP62P37198 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP62P37198 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP62P37198 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP62P37198 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP62P37198 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP62P37198 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP62P37198 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP62P37198 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP62P37198 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP62P37198 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP62P37198 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP62P37198 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP62P37198 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP62P37198 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP62P37198 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP62P37198 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP62P37198 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP62P37198 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP62P37198 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP62P37198 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP62P37198 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP62P37198 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP62P37198 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP62P37198 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP62P37198 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP62P37198 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP62P37198 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP62P37198 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP62P37198 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP62P37198 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP62P37198 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP62P37198 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP62P37198 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP62P37198 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP62P37198 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP62P37198 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP62P37198 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP62P37198 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP62P37198 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP62P37198 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP62P37198 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP62P37198 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP62P37198 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP62P37198 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP62P37198 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP62P37198 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP62P37198 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP62P37198 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP62P37198 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP62P37198 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP62P37198 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP62P37198 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP62P37198 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62P37198 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62P37198 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP62P37198 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP62P37198 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62P37198 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62P37198 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62P37198 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62P37198 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP62P37198 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62P37198 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62P37198 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62P37198 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62P37198 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62P37198 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62P37198 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms