Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KRT2P35908 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KRT2P35908 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KRT2P35908 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KRT2P35908 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KRT2P35908 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KRT2P35908 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KRT2P35908 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KRT2P35908 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KRT2P35908 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KRT2P35908 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KRT2P35908 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT2P35908 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT2P35908 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KRT2P35908 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
KRT2P35908 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KRT2P35908 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KRT2P35908 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT2P35908 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
KRT2P35908 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT2P35908 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT2P35908 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT2P35908 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT2P35908 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT2P35908 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT2P35908 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT2P35908 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT2P35908 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT2P35908 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT2P35908 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT2P35908 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT2P35908 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT2P35908 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT2P35908 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
KRT2P35908 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT2P35908 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
KRT2P35908 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KRT2P35908 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KRT2P35908 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KRT2P35908 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KRT2P35908 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KRT2P35908 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KRT2P35908 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KRT2P35908 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
KRT2P35908 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KRT2P35908 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KRT2P35908 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KRT2P35908 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
KRT2P35908 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KRT2P35908 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KRT2P35908 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KRT2P35908 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KRT2P35908 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KRT2P35908 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KRT2P35908 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KRT2P35908 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KRT2P35908 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KRT2P35908 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KRT2P35908 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KRT2P35908 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KRT2P35908 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KRT2P35908 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT2P35908 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT2P35908 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT2P35908 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT2P35908 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT2P35908 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT2P35908 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT2P35908 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KRT2P35908 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KRT2P35908 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KRT2P35908 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KRT2P35908 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KRT2P35908 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KRT2P35908 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KRT2P35908 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KRT2P35908 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KRT2P35908 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KRT2P35908 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KRT2P35908 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KRT2P35908 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KRT2P35908 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
KRT2P35908 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KRT2P35908 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KRT2P35908 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KRT2P35908 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KRT2P35908 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KRT2P35908 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KRT2P35908 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KRT2P35908 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KRT2P35908 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KRT2P35908 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KRT2P35908 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KRT2P35908 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KRT2P35908 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
KRT2P35908 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KRT2P35908 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KRT2P35908 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KRT2P35908 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KRT2P35908 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms