Protein–RNA interactions for Protein: P30040

ERP29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP29P30040 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERP29P30040 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP29P30040 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERP29P30040 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP29P30040 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP29P30040 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERP29P30040 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP29P30040 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERP29P30040 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERP29P30040 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP29P30040 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERP29P30040 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP29P30040 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP29P30040 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP29P30040 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERP29P30040 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP29P30040 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERP29P30040 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP29P30040 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP29P30040 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERP29P30040 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP29P30040 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP29P30040 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP29P30040 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP29P30040 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP29P30040 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERP29P30040 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERP29P30040 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP29P30040 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP29P30040 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP29P30040 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP29P30040 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERP29P30040 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP29P30040 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP29P30040 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERP29P30040 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP29P30040 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP29P30040 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERP29P30040 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP29P30040 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP29P30040 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP29P30040 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP29P30040 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERP29P30040 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP29P30040 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP29P30040 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP29P30040 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP29P30040 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP29P30040 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP29P30040 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERP29P30040 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP29P30040 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP29P30040 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP29P30040 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERP29P30040 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERP29P30040 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERP29P30040 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERP29P30040 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERP29P30040 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERP29P30040 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERP29P30040 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERP29P30040 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERP29P30040 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERP29P30040 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP29P30040 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP29P30040 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP29P30040 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP29P30040 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP29P30040 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP29P30040 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP29P30040 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP29P30040 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP29P30040 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP29P30040 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP29P30040 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP29P30040 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP29P30040 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP29P30040 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP29P30040 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP29P30040 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP29P30040 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP29P30040 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP29P30040 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP29P30040 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP29P30040 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP29P30040 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP29P30040 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP29P30040 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP29P30040 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP29P30040 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP29P30040 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP29P30040 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP29P30040 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP29P30040 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP29P30040 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERP29P30040 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERP29P30040 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERP29P30040 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERP29P30040 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERP29P30040 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms