Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD34P28906 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD34P28906 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD34P28906 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD34P28906 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD34P28906 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD34P28906 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD34P28906 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD34P28906 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD34P28906 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD34P28906 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD34P28906 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD34P28906 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD34P28906 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD34P28906 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD34P28906 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD34P28906 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD34P28906 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD34P28906 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD34P28906 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD34P28906 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD34P28906 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD34P28906 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD34P28906 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD34P28906 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD34P28906 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD34P28906 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD34P28906 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD34P28906 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD34P28906 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD34P28906 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD34P28906 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD34P28906 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD34P28906 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD34P28906 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD34P28906 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD34P28906 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD34P28906 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD34P28906 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD34P28906 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD34P28906 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD34P28906 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD34P28906 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD34P28906 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD34P28906 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD34P28906 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD34P28906 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD34P28906 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD34P28906 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD34P28906 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD34P28906 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD34P28906 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD34P28906 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD34P28906 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD34P28906 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD34P28906 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD34P28906 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD34P28906 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD34P28906 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD34P28906 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD34P28906 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD34P28906 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD34P28906 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD34P28906 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD34P28906 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD34P28906 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD34P28906 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD34P28906 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD34P28906 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD34P28906 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD34P28906 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD34P28906 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD34P28906 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD34P28906 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD34P28906 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD34P28906 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD34P28906 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CD34P28906 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD34P28906 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD34P28906 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD34P28906 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD34P28906 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD34P28906 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD34P28906 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD34P28906 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD34P28906 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD34P28906 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD34P28906 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD34P28906 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD34P28906 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD34P28906 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD34P28906 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD34P28906 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD34P28906 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD34P28906 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD34P28906 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD34P28906 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD34P28906 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD34P28906 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD34P28906 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms