Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APEX1P27695 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX1P27695 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APEX1P27695 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX1P27695 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX1P27695 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX1P27695 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX1P27695 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APEX1P27695 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX1P27695 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX1P27695 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX1P27695 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APEX1P27695 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APEX1P27695 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APEX1P27695 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX1P27695 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX1P27695 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX1P27695 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX1P27695 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APEX1P27695 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX1P27695 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX1P27695 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX1P27695 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APEX1P27695 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX1P27695 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX1P27695 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APEX1P27695 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX1P27695 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APEX1P27695 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX1P27695 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX1P27695 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APEX1P27695 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APEX1P27695 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APEX1P27695 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX1P27695 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX1P27695 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APEX1P27695 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX1P27695 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX1P27695 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX1P27695 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX1P27695 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX1P27695 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX1P27695 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX1P27695 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX1P27695 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX1P27695 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX1P27695 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX1P27695 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX1P27695 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX1P27695 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APEX1P27695 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APEX1P27695 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX1P27695 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX1P27695 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX1P27695 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX1P27695 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX1P27695 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX1P27695 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX1P27695 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX1P27695 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX1P27695 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX1P27695 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX1P27695 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX1P27695 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX1P27695 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX1P27695 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX1P27695 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX1P27695 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX1P27695 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX1P27695 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX1P27695 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX1P27695 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX1P27695 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX1P27695 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX1P27695 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX1P27695 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX1P27695 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX1P27695 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX1P27695 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX1P27695 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX1P27695 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX1P27695 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX1P27695 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX1P27695 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX1P27695 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX1P27695 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX1P27695 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX1P27695 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX1P27695 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX1P27695 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX1P27695 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX1P27695 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX1P27695 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX1P27695 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX1P27695 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX1P27695 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX1P27695 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX1P27695 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX1P27695 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX1P27695 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms