Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMA3P25788 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA3P25788 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
PSMA3P25788 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMA3P25788 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMA3P25788 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSMA3P25788 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSMA3P25788 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMA3P25788 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMA3P25788 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMA3P25788 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMA3P25788 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMA3P25788 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMA3P25788 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMA3P25788 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMA3P25788 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms