Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAMP1P23763 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP1P23763 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP1P23763 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAMP1P23763 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP1P23763 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms