Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCN1P20061 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCN1P20061 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCN1P20061 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCN1P20061 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCN1P20061 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCN1P20061 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCN1P20061 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCN1P20061 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCN1P20061 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCN1P20061 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCN1P20061 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCN1P20061 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCN1P20061 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCN1P20061 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCN1P20061 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCN1P20061 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCN1P20061 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCN1P20061 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCN1P20061 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCN1P20061 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCN1P20061 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCN1P20061 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCN1P20061 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCN1P20061 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN1P20061 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN1P20061 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCN1P20061 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCN1P20061 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCN1P20061 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCN1P20061 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCN1P20061 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCN1P20061 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCN1P20061 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCN1P20061 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCN1P20061 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCN1P20061 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TCN1P20061 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCN1P20061 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCN1P20061 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCN1P20061 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCN1P20061 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCN1P20061 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCN1P20061 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCN1P20061 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCN1P20061 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCN1P20061 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCN1P20061 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCN1P20061 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCN1P20061 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN1P20061 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN1P20061 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN1P20061 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN1P20061 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN1P20061 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN1P20061 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN1P20061 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCN1P20061 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCN1P20061 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCN1P20061 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCN1P20061 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCN1P20061 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCN1P20061 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCN1P20061 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCN1P20061 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCN1P20061 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCN1P20061 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCN1P20061 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCN1P20061 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCN1P20061 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCN1P20061 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCN1P20061 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCN1P20061 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCN1P20061 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCN1P20061 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCN1P20061 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCN1P20061 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCN1P20061 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCN1P20061 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCN1P20061 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCN1P20061 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCN1P20061 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCN1P20061 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCN1P20061 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCN1P20061 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCN1P20061 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCN1P20061 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCN1P20061 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCN1P20061 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCN1P20061 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCN1P20061 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCN1P20061 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCN1P20061 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCN1P20061 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCN1P20061 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCN1P20061 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCN1P20061 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCN1P20061 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCN1P20061 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCN1P20061 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms