Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2EP19388 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2EP19388 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2EP19388 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2EP19388 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2EP19388 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2EP19388 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2EP19388 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2EP19388 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2EP19388 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2EP19388 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2EP19388 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
POLR2EP19388 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2EP19388 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms