Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DESP17661 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DESP17661 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DESP17661 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DESP17661 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DESP17661 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DESP17661 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DESP17661 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DESP17661 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DESP17661 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DESP17661 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DESP17661 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DESP17661 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DESP17661 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DESP17661 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DESP17661 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DESP17661 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DESP17661 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DESP17661 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DESP17661 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DESP17661 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DESP17661 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DESP17661 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DESP17661 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DESP17661 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DESP17661 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DESP17661 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DESP17661 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DESP17661 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DESP17661 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DESP17661 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DESP17661 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DESP17661 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DESP17661 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DESP17661 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DESP17661 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DESP17661 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DESP17661 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DESP17661 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DESP17661 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DESP17661 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DESP17661 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DESP17661 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DESP17661 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DESP17661 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DESP17661 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DESP17661 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DESP17661 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DESP17661 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DESP17661 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DESP17661 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DESP17661 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DESP17661 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DESP17661 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DESP17661 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DESP17661 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DESP17661 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
DESP17661 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DESP17661 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DESP17661 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DESP17661 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DESP17661 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DESP17661 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DESP17661 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DESP17661 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DESP17661 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DESP17661 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DESP17661 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DESP17661 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DESP17661 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DESP17661 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DESP17661 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DESP17661 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DESP17661 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DESP17661 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DESP17661 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DESP17661 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DESP17661 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DESP17661 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DESP17661 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DESP17661 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DESP17661 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DESP17661 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DESP17661 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DESP17661 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DESP17661 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DESP17661 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DESP17661 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DESP17661 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DESP17661 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DESP17661 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DESP17661 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
DESP17661 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DESP17661 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DESP17661 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DESP17661 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DESP17661 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
DESP17661 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DESP17661 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DESP17661 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms