Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB1P12018 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPREB1P12018 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB1P12018 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VPREB1P12018 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPREB1P12018 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms