Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBL4AP11441 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBL4AP11441 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL4AP11441 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBL4AP11441 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBL4AP11441 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms