Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-13P0DP09 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1-13P0DP09 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1-13P0DP09 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1-13P0DP09 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1-13P0DP09 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1-13P0DP09 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1-13P0DP09 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1-13P0DP09 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1-13P0DP09 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1-13P0DP09 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1-13P0DP09 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1-13P0DP09 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV1-13P0DP09 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1-13P0DP09 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGKV1-13P0DP09 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms