Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3L1P0CL83 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3L1P0CL83 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3L1P0CL83 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3L1P0CL83 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STAG3L1P0CL83 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STAG3L1P0CL83 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STAG3L1P0CL83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
STAG3L1P0CL83 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
STAG3L1P0CL83 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG3L1P0CL83 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG3L1P0CL83 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms