Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P0C879 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P0C879 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P0C879 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P0C879 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P0C879 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P0C879 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P0C879 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P0C879 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P0C879 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P0C879 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P0C879 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P0C879 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P0C879 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P0C879 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P0C879 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P0C879 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P0C879 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P0C879 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P0C879 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P0C879 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P0C879 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P0C879 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P0C879 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P0C879 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P0C879 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P0C879 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P0C879 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P0C879 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P0C879 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P0C879 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P0C879 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
P0C879 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P0C879 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P0C879 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P0C879 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P0C879 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P0C879 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P0C879 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P0C879 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P0C879 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P0C879 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P0C879 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P0C879 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P0C879 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P0C879 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P0C879 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P0C879 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P0C879 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P0C879 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P0C879 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P0C879 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P0C879 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P0C879 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P0C879 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P0C879 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P0C879 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P0C879 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P0C879 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P0C879 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P0C879 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P0C879 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P0C879 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P0C879 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P0C879 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P0C879 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P0C879 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P0C879 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P0C879 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P0C879 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P0C879 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P0C879 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P0C879 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P0C879 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P0C879 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P0C879 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P0C879 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P0C879 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P0C879 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P0C879 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P0C879 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P0C879 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P0C879 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P0C879 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P0C879 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P0C879 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P0C879 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
P0C879 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P0C879 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P0C879 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P0C879 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P0C879 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P0C879 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P0C879 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P0C879 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P0C879 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P0C879 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P0C879 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P0C879 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P0C879 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms