Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-DQB2P05538 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DQB2P05538 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HLA-DQB2P05538 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DQB2P05538 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DQB2P05538 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-DQB2P05538 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms