Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MT-CO1P00395 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MT-CO1P00395 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MT-CO1P00395 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MT-CO1P00395 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MT-CO1P00395 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MT-CO1P00395 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MT-CO1P00395 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms