Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBB3O95704 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBB3O95704 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBB3O95704 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBB3O95704 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APBB3O95704 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APBB3O95704 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APBB3O95704 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APBB3O95704 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APBB3O95704 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APBB3O95704 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APBB3O95704 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APBB3O95704 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APBB3O95704 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
APBB3O95704 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
APBB3O95704 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APBB3O95704 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APBB3O95704 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APBB3O95704 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APBB3O95704 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBB3O95704 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBB3O95704 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
APBB3O95704 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBB3O95704 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBB3O95704 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBB3O95704 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBB3O95704 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBB3O95704 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBB3O95704 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBB3O95704 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBB3O95704 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBB3O95704 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBB3O95704 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
APBB3O95704 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBB3O95704 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBB3O95704 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBB3O95704 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBB3O95704 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBB3O95704 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBB3O95704 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBB3O95704 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APBB3O95704 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APBB3O95704 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APBB3O95704 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBB3O95704 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
APBB3O95704 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBB3O95704 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBB3O95704 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APBB3O95704 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APBB3O95704 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APBB3O95704 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBB3O95704 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBB3O95704 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBB3O95704 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBB3O95704 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBB3O95704 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBB3O95704 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBB3O95704 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
APBB3O95704 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBB3O95704 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBB3O95704 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBB3O95704 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBB3O95704 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBB3O95704 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBB3O95704 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBB3O95704 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
APBB3O95704 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBB3O95704 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBB3O95704 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APBB3O95704 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APBB3O95704 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APBB3O95704 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APBB3O95704 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APBB3O95704 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APBB3O95704 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APBB3O95704 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APBB3O95704 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APBB3O95704 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APBB3O95704 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APBB3O95704 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APBB3O95704 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APBB3O95704 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APBB3O95704 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APBB3O95704 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APBB3O95704 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APBB3O95704 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
APBB3O95704 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APBB3O95704 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APBB3O95704 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APBB3O95704 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APBB3O95704 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APBB3O95704 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APBB3O95704 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APBB3O95704 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APBB3O95704 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APBB3O95704 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APBB3O95704 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
APBB3O95704 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APBB3O95704 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APBB3O95704 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms