Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT4O95628 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT4O95628 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT4O95628 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT4O95628 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms