Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN7O94888 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN7O94888 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN7O94888 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN7O94888 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN7O94888 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN7O94888 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN7O94888 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN7O94888 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN7O94888 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN7O94888 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN7O94888 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN7O94888 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN7O94888 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN7O94888 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms