Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP9BO43861 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP9BO43861 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP9BO43861 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP9BO43861 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP9BO43861 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP9BO43861 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP9BO43861 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP9BO43861 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP9BO43861 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP9BO43861 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP9BO43861 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP9BO43861 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP9BO43861 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP9BO43861 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP9BO43861 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP9BO43861 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP9BO43861 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP9BO43861 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP9BO43861 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP9BO43861 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP9BO43861 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms