Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCEO43556 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCEO43556 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCEO43556 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCEO43556 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCEO43556 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCEO43556 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGCEO43556 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCEO43556 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCEO43556 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCEO43556 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCEO43556 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCEO43556 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCEO43556 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCEO43556 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCEO43556 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCEO43556 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCEO43556 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCEO43556 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCEO43556 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCEO43556 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCEO43556 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCEO43556 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCEO43556 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCEO43556 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCEO43556 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCEO43556 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCEO43556 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCEO43556 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCEO43556 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCEO43556 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCEO43556 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCEO43556 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCEO43556 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCEO43556 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCEO43556 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCEO43556 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCEO43556 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCEO43556 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCEO43556 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCEO43556 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCEO43556 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCEO43556 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCEO43556 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCEO43556 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCEO43556 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCEO43556 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCEO43556 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCEO43556 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCEO43556 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCEO43556 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCEO43556 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCEO43556 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCEO43556 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCEO43556 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCEO43556 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCEO43556 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCEO43556 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCEO43556 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCEO43556 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCEO43556 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCEO43556 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCEO43556 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCEO43556 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCEO43556 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCEO43556 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCEO43556 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCEO43556 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCEO43556 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCEO43556 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCEO43556 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCEO43556 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCEO43556 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCEO43556 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCEO43556 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCEO43556 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCEO43556 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCEO43556 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCEO43556 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCEO43556 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCEO43556 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGCEO43556 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCEO43556 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCEO43556 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCEO43556 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCEO43556 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCEO43556 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCEO43556 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCEO43556 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCEO43556 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCEO43556 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCEO43556 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCEO43556 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCEO43556 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCEO43556 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCEO43556 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCEO43556 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCEO43556 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCEO43556 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCEO43556 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms