Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CBFA2T2O43439 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CBFA2T2O43439 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CBFA2T2O43439 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CBFA2T2O43439 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CBFA2T2O43439 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CBFA2T2O43439 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CBFA2T2O43439 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CBFA2T2O43439 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CBFA2T2O43439 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CBFA2T2O43439 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CBFA2T2O43439 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CBFA2T2O43439 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CBFA2T2O43439 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CBFA2T2O43439 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CBFA2T2O43439 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CBFA2T2O43439 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CBFA2T2O43439 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CBFA2T2O43439 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CBFA2T2O43439 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CBFA2T2O43439 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms