Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PJA2O43164 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PJA2O43164 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PJA2O43164 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PJA2O43164 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PJA2O43164 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PJA2O43164 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PJA2O43164 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PJA2O43164 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PJA2O43164 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PJA2O43164 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PJA2O43164 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PJA2O43164 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PJA2O43164 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PJA2O43164 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PJA2O43164 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PJA2O43164 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PJA2O43164 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PJA2O43164 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PJA2O43164 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PJA2O43164 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PJA2O43164 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PJA2O43164 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PJA2O43164 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PJA2O43164 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PJA2O43164 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PJA2O43164 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PJA2O43164 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PJA2O43164 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PJA2O43164 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PJA2O43164 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PJA2O43164 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PJA2O43164 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PJA2O43164 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PJA2O43164 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PJA2O43164 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PJA2O43164 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PJA2O43164 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PJA2O43164 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PJA2O43164 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PJA2O43164 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PJA2O43164 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PJA2O43164 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PJA2O43164 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PJA2O43164 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PJA2O43164 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PJA2O43164 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PJA2O43164 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PJA2O43164 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PJA2O43164 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PJA2O43164 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PJA2O43164 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PJA2O43164 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PJA2O43164 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PJA2O43164 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PJA2O43164 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PJA2O43164 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PJA2O43164 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PJA2O43164 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PJA2O43164 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PJA2O43164 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PJA2O43164 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PJA2O43164 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PJA2O43164 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PJA2O43164 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PJA2O43164 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PJA2O43164 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PJA2O43164 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PJA2O43164 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PJA2O43164 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PJA2O43164 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PJA2O43164 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PJA2O43164 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PJA2O43164 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PJA2O43164 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PJA2O43164 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PJA2O43164 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PJA2O43164 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PJA2O43164 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PJA2O43164 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PJA2O43164 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PJA2O43164 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PJA2O43164 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PJA2O43164 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PJA2O43164 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PJA2O43164 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PJA2O43164 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PJA2O43164 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PJA2O43164 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PJA2O43164 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PJA2O43164 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PJA2O43164 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PJA2O43164 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PJA2O43164 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PJA2O43164 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PJA2O43164 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PJA2O43164 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PJA2O43164 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PJA2O43164 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PJA2O43164 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms