Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PER1O15534 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PER1O15534 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PER1O15534 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PER1O15534 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PER1O15534 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PER1O15534 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PER1O15534 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PER1O15534 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PER1O15534 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PER1O15534 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PER1O15534 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PER1O15534 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PER1O15534 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PER1O15534 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PER1O15534 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PER1O15534 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PER1O15534 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
PER1O15534 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PER1O15534 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PER1O15534 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PER1O15534 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PER1O15534 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PER1O15534 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PER1O15534 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PER1O15534 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PER1O15534 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PER1O15534 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PER1O15534 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PER1O15534 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PER1O15534 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PER1O15534 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PER1O15534 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PER1O15534 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PER1O15534 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PER1O15534 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
PER1O15534 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
PER1O15534 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PER1O15534 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PER1O15534 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PER1O15534 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PER1O15534 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PER1O15534 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PER1O15534 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PER1O15534 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PER1O15534 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PER1O15534 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PER1O15534 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PER1O15534 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PER1O15534 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PER1O15534 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PER1O15534 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PER1O15534 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PER1O15534 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PER1O15534 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PER1O15534 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PER1O15534 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PER1O15534 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PER1O15534 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PER1O15534 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PER1O15534 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PER1O15534 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PER1O15534 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PER1O15534 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PER1O15534 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PER1O15534 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PER1O15534 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PER1O15534 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
PER1O15534 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PER1O15534 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PER1O15534 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PER1O15534 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PER1O15534 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PER1O15534 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PER1O15534 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PER1O15534 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PER1O15534 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PER1O15534 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PER1O15534 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PER1O15534 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PER1O15534 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PER1O15534 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PER1O15534 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PER1O15534 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PER1O15534 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
PER1O15534 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PER1O15534 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PER1O15534 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PER1O15534 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PER1O15534 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PER1O15534 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PER1O15534 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PER1O15534 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PER1O15534 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PER1O15534 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PER1O15534 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PER1O15534 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PER1O15534 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PER1O15534 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PER1O15534 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms