Protein–RNA interactions for Protein: O15482

TEX28, Testis-specific protein TEX28, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEX28O15482 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TEX28O15482 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TEX28O15482 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TEX28O15482 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TEX28O15482 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TEX28O15482 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TEX28O15482 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TEX28O15482 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TEX28O15482 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TEX28O15482 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TEX28O15482 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TEX28O15482 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TEX28O15482 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TEX28O15482 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TEX28O15482 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TEX28O15482 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TEX28O15482 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TEX28O15482 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TEX28O15482 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TEX28O15482 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TEX28O15482 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TEX28O15482 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TEX28O15482 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TEX28O15482 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TEX28O15482 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TEX28O15482 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TEX28O15482 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TEX28O15482 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TEX28O15482 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TEX28O15482 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TEX28O15482 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TEX28O15482 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TEX28O15482 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TEX28O15482 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TEX28O15482 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TEX28O15482 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TEX28O15482 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TEX28O15482 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TEX28O15482 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TEX28O15482 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TEX28O15482 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TEX28O15482 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TEX28O15482 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TEX28O15482 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TEX28O15482 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TEX28O15482 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TEX28O15482 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TEX28O15482 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TEX28O15482 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TEX28O15482 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TEX28O15482 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TEX28O15482 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TEX28O15482 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TEX28O15482 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TEX28O15482 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TEX28O15482 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TEX28O15482 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TEX28O15482 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TEX28O15482 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TEX28O15482 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TEX28O15482 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TEX28O15482 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TEX28O15482 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TEX28O15482 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TEX28O15482 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TEX28O15482 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TEX28O15482 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TEX28O15482 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TEX28O15482 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TEX28O15482 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TEX28O15482 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TEX28O15482 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TEX28O15482 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TEX28O15482 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEX28O15482 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEX28O15482 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEX28O15482 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TEX28O15482 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TEX28O15482 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TEX28O15482 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TEX28O15482 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TEX28O15482 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TEX28O15482 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TEX28O15482 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TEX28O15482 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TEX28O15482 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TEX28O15482 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TEX28O15482 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TEX28O15482 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TEX28O15482 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TEX28O15482 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TEX28O15482 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TEX28O15482 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TEX28O15482 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TEX28O15482 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TEX28O15482 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TEX28O15482 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TEX28O15482 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TEX28O15482 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TEX28O15482 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms