Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLGNO14967 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLGNO14967 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLGNO14967 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLGNO14967 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLGNO14967 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLGNO14967 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLGNO14967 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLGNO14967 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLGNO14967 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLGNO14967 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLGNO14967 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLGNO14967 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLGNO14967 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLGNO14967 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLGNO14967 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLGNO14967 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLGNO14967 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLGNO14967 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLGNO14967 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLGNO14967 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLGNO14967 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLGNO14967 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CLGNO14967 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLGNO14967 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLGNO14967 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLGNO14967 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLGNO14967 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLGNO14967 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLGNO14967 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLGNO14967 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLGNO14967 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLGNO14967 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLGNO14967 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLGNO14967 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLGNO14967 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLGNO14967 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLGNO14967 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLGNO14967 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLGNO14967 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLGNO14967 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLGNO14967 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLGNO14967 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLGNO14967 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLGNO14967 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLGNO14967 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLGNO14967 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLGNO14967 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLGNO14967 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLGNO14967 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLGNO14967 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLGNO14967 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLGNO14967 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLGNO14967 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLGNO14967 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLGNO14967 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLGNO14967 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLGNO14967 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLGNO14967 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLGNO14967 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLGNO14967 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLGNO14967 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLGNO14967 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLGNO14967 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLGNO14967 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLGNO14967 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CLGNO14967 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLGNO14967 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLGNO14967 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLGNO14967 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLGNO14967 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLGNO14967 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLGNO14967 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLGNO14967 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLGNO14967 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLGNO14967 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLGNO14967 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLGNO14967 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLGNO14967 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLGNO14967 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLGNO14967 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLGNO14967 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLGNO14967 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLGNO14967 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLGNO14967 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLGNO14967 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLGNO14967 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLGNO14967 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLGNO14967 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLGNO14967 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLGNO14967 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLGNO14967 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLGNO14967 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLGNO14967 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLGNO14967 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLGNO14967 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLGNO14967 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CLGNO14967 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLGNO14967 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLGNO14967 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms