Protein–RNA interactions for Protein: O00300

TNFRSF11B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11B, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11BO00300 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF11BO00300 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF11BO00300 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF11BO00300 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF11BO00300 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF11BO00300 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF11BO00300 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms