Protein–RNA interactions for Protein: O00194

RAB27B, Ras-related protein Rab-27B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27BO00194 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB27BO00194 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB27BO00194 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB27BO00194 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27BO00194 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB27BO00194 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms