Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01387J3KSC0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01387J3KSC0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01387J3KSC0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01387J3KSC0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01387J3KSC0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01387J3KSC0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms