Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms