Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf92A6NGG3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf92A6NGG3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf92A6NGG3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms