Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM89A2RUT3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM89A2RUT3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM89A2RUT3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM89A2RUT3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM89A2RUT3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM89A2RUT3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms