Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIPSLA2A3N6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIPSLA2A3N6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIPSLA2A3N6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIPSLA2A3N6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIPSLA2A3N6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PIPSLA2A3N6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIPSLA2A3N6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PIPSLA2A3N6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIPSLA2A3N6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms