Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC82Q8N4S0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC82Q8N4S0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC82Q8N4S0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms