Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms