Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SIRT1Q96EB6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIRT1Q96EB6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIRT1Q96EB6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms