RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378979.8

C20orf196-202, Transcript of Uncharacterized protein C20orf196, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C20orf196, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf196-202ENST00000378979 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.4■■■■■ 5.5
C20orf196-202ENST00000378979 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.02■■■■■ 4.64
C20orf196-202ENST00000378979 ABCC9O60706 1549 aa43.02■■■■■ 4.48
C20orf196-202ENST00000378979 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.44■■■■■ 4.22
C20orf196-202ENST00000378979 NACADO15069 1562 aa41.37■■■■■ 4.21
C20orf196-202ENST00000378979 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.3■■■■■ 4.2
C20orf196-202ENST00000378979 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
C20orf196-202ENST00000378979 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.09■■■■■ 4.17
C20orf196-202ENST00000378979 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.91■■■■■ 4.14
C20orf196-202ENST00000378979 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.45■■■■■ 4.07
C20orf196-202ENST00000378979 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.02
C20orf196-202ENST00000378979 SCRIBQ14160 1630 aa40.11■■■■■ 4.01
C20orf196-202ENST00000378979 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.1■■■■■ 4.01
C20orf196-202ENST00000378979 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.78■■■■□ 3.96
C20orf196-202ENST00000378979 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.39■■■■□ 3.9
C20orf196-202ENST00000378979 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
C20orf196-202ENST00000378979 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.92■■■■□ 3.82
C20orf196-202ENST00000378979 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
C20orf196-202ENST00000378979 SMARCA4P51532 1647 aa38.37■■■■□ 3.73
C20orf196-202ENST00000378979 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
C20orf196-202ENST00000378979 SMARCA2P51531 1590 aa38.15■■■■□ 3.7
C20orf196-202ENST00000378979 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.13■■■■□ 3.69
C20orf196-202ENST00000378979 NCAPD3P42695 1498 aa38.12■■■■□ 3.69
C20orf196-202ENST00000378979 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.05■■■■□ 3.68
C20orf196-202ENST00000378979 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.98■■■■□ 3.67
C20orf196-202ENST00000378979 HMGXB3Q12766 1538 aa37.97■■■■□ 3.67
C20orf196-202ENST00000378979 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
C20orf196-202ENST00000378979 WIZO95785 1651 aa37.66■■■■□ 3.62
C20orf196-202ENST00000378979 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
C20orf196-202ENST00000378979 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
C20orf196-202ENST00000378979 NESP48681 1621 aa37.18■■■■□ 3.54
C20orf196-202ENST00000378979 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.18■■■■□ 3.54
C20orf196-202ENST00000378979 ERCC6Q03468 1493 aa37.14■■■■□ 3.54
C20orf196-202ENST00000378979 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.02■■■■□ 3.52
C20orf196-202ENST00000378979 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.93■■■■□ 3.5
C20orf196-202ENST00000378979 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.81■■■■□ 3.48
C20orf196-202ENST00000378979 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.81■■■■□ 3.48
C20orf196-202ENST00000378979 CFTRP13569 1480 aa36.78■■■■□ 3.48
C20orf196-202ENST00000378979 CUX2O14529 1486 aa36.75■■■■□ 3.47
C20orf196-202ENST00000378979 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
C20orf196-202ENST00000378979 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
C20orf196-202ENST00000378979 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.61■■■■□ 3.45
C20orf196-202ENST00000378979 PRDM2Q13029 1718 aa36.59■■■■□ 3.45
C20orf196-202ENST00000378979 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.59■■■■□ 3.45
C20orf196-202ENST00000378979 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.53■■■■□ 3.44
C20orf196-202ENST00000378979 WDR62O43379 1518 aa36.4■■■■□ 3.42
C20orf196-202ENST00000378979 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
C20orf196-202ENST00000378979 ABCC8Q09428 1581 aa36.07■■■■□ 3.37
C20orf196-202ENST00000378979 TOPBP1Q92547 1522 aa36.01■■■■□ 3.36
C20orf196-202ENST00000378979 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36■■■■□ 3.35
C20orf196-202ENST00000378979 IFT140Q96RY7 1462 aa35.81■■■■□ 3.32
C20orf196-202ENST00000378979 CUX1P39880 1505 aa35.71■■■■□ 3.31
C20orf196-202ENST00000378979 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
C20orf196-202ENST00000378979 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
C20orf196-202ENST00000378979 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.61■■■■□ 3.29
C20orf196-202ENST00000378979 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
C20orf196-202ENST00000378979 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.59■■■■□ 3.29
C20orf196-202ENST00000378979 SOGA1O94964 1423 aa35.56■■■■□ 3.28
C20orf196-202ENST00000378979 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
C20orf196-202ENST00000378979 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.51■■■■□ 3.28
C20orf196-202ENST00000378979 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.5■■■■□ 3.27
C20orf196-202ENST00000378979 TOP2BQ02880 1626 aa35.44■■■■□ 3.26
C20orf196-202ENST00000378979 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.44■■■■□ 3.26
C20orf196-202ENST00000378979 WDR97A6NE52 1622 aa35.41■■■■□ 3.26
C20orf196-202ENST00000378979 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.4■■■■□ 3.26
C20orf196-202ENST00000378979 SYNJ1O43426 1573 aa35.39■■■■□ 3.26
C20orf196-202ENST00000378979 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
C20orf196-202ENST00000378979 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.27■■■■□ 3.24
C20orf196-202ENST00000378979 OSCARQ8IYS5 282 aa35.2■■■■□ 3.23
C20orf196-202ENST00000378979 GRIN2BQ13224 1484 aa35.16■■■■□ 3.22
C20orf196-202ENST00000378979 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.16■■■■□ 3.22
C20orf196-202ENST00000378979 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.14■■■■□ 3.22
C20orf196-202ENST00000378979 PBRM1Q86U86 1689 aa35.13■■■■□ 3.21
C20orf196-202ENST00000378979 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.1■■■■□ 3.21
C20orf196-202ENST00000378979 CHD1O14646 1710 aa35.09■■■■□ 3.21
C20orf196-202ENST00000378979 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
C20orf196-202ENST00000378979 FBLN2P98095 1184 aa35.02■■■■□ 3.2
C20orf196-202ENST00000378979 SYNJ2O15056 1496 aa34.95■■■■□ 3.19
C20orf196-202ENST00000378979 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
C20orf196-202ENST00000378979 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.88■■■■□ 3.17
C20orf196-202ENST00000378979 ADAMTS12P58397 1594 aa34.82■■■■□ 3.16
C20orf196-202ENST00000378979 KIF27Q86VH2 1401 aa34.78■■■■□ 3.16
C20orf196-202ENST00000378979 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.75■■■■□ 3.15
C20orf196-202ENST00000378979 GRIN2AQ12879 1464 aa34.71■■■■□ 3.15
C20orf196-202ENST00000378979 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.67■■■■□ 3.14
C20orf196-202ENST00000378979 TRIM41Q8WV44 630 aa34.65■■■■□ 3.14
C20orf196-202ENST00000378979 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.64■■■■□ 3.14
C20orf196-202ENST00000378979 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.64■■■■□ 3.14
C20orf196-202ENST00000378979 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.64■■■■□ 3.14
C20orf196-202ENST00000378979 ARHGEF11O15085 1522 aa34.62■■■■□ 3.13
C20orf196-202ENST00000378979 CUL7Q14999 1698 aa34.6■■■■□ 3.13
C20orf196-202ENST00000378979 IGF1RP08069 1367 aa34.57■■■■□ 3.12
C20orf196-202ENST00000378979 NUP160Q12769 1436 aa34.53■■■■□ 3.12
C20orf196-202ENST00000378979 CEP170Q5SW79 1584 aa34.52■■■■□ 3.12
C20orf196-202ENST00000378979 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.4■■■■□ 3.1
C20orf196-202ENST00000378979 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.35■■■■□ 3.09
C20orf196-202ENST00000378979 ARAP1Q96P48 1450 aa34.32■■■■□ 3.08
C20orf196-202ENST00000378979 SHROOM2Q13796 1616 aa34.3■■■■□ 3.08
C20orf196-202ENST00000378979 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.28■■■■□ 3.08
C20orf196-202ENST00000378979 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms