RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366988.4

NENF-201, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NENF, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-201ENST00000366988 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.63■■■■■ 5.54
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NENF-201ENST00000366988 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.82■■■■■ 4.29
NENF-201ENST00000366988 NACADO15069 1562 aa41.68■■■■■ 4.26
NENF-201ENST00000366988 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.61■■■■■ 4.25
NENF-201ENST00000366988 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.31■■■■■ 4.2
NENF-201ENST00000366988 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
NENF-201ENST00000366988 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.04■■■■■ 4.16
NENF-201ENST00000366988 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.9■■■■■ 4.14
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NENF-201ENST00000366988 SCRIBQ14160 1630 aa40.42■■■■■ 4.06
NENF-201ENST00000366988 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.12■■■■■ 4.01
NENF-201ENST00000366988 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.09■■■■■ 4.01
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NENF-201ENST00000366988 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.41■■■■□ 3.9
NENF-201ENST00000366988 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.17■■■■□ 3.86
NENF-201ENST00000366988 SMARCA4P51532 1647 aa38.6■■■■□ 3.77
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NENF-201ENST00000366988 NCAPD3P42695 1498 aa38.41■■■■□ 3.74
NENF-201ENST00000366988 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.41■■■■□ 3.74
NENF-201ENST00000366988 SMARCA2P51531 1590 aa38.4■■■■□ 3.74
NENF-201ENST00000366988 HMGXB3Q12766 1538 aa38.26■■■■□ 3.72
NENF-201ENST00000366988 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.24■■■■□ 3.71
NENF-201ENST00000366988 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.19■■■■□ 3.7
NENF-201ENST00000366988 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
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NENF-201ENST00000366988 ERCC6Q03468 1493 aa37.62■■■■□ 3.61
NENF-201ENST00000366988 NESP48681 1621 aa37.61■■■■□ 3.61
NENF-201ENST00000366988 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.51■■■■□ 3.59
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NENF-201ENST00000366988 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.29■■■■□ 3.56
NENF-201ENST00000366988 CUX2O14529 1486 aa37.27■■■■□ 3.56
NENF-201ENST00000366988 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.25■■■■□ 3.55
NENF-201ENST00000366988 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.22■■■■□ 3.55
NENF-201ENST00000366988 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
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NENF-201ENST00000366988 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.96■■■■□ 3.51
NENF-201ENST00000366988 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.9■■■■□ 3.5
NENF-201ENST00000366988 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.9■■■■□ 3.5
NENF-201ENST00000366988 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.88■■■■□ 3.5
NENF-201ENST00000366988 PRDM2Q13029 1718 aa36.85■■■■□ 3.49
NENF-201ENST00000366988 WDR62O43379 1518 aa36.78■■■■□ 3.48
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NENF-201ENST00000366988 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.37■■■■□ 3.41
NENF-201ENST00000366988 TOPBP1Q92547 1522 aa36.28■■■■□ 3.4
NENF-201ENST00000366988 ABCC8Q09428 1581 aa36.27■■■■□ 3.4
NENF-201ENST00000366988 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.24■■■■□ 3.39
NENF-201ENST00000366988 IFT140Q96RY7 1462 aa36.12■■■■□ 3.37
NENF-201ENST00000366988 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
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NENF-201ENST00000366988 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
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NENF-201ENST00000366988 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
NENF-201ENST00000366988 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.84■■■■□ 3.33
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NENF-201ENST00000366988 WDR97A6NE52 1622 aa35.64■■■■□ 3.3
NENF-201ENST00000366988 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
NENF-201ENST00000366988 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.58■■■■□ 3.29
NENF-201ENST00000366988 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.57■■■■□ 3.28
NENF-201ENST00000366988 TOP2BQ02880 1626 aa35.55■■■■□ 3.28
NENF-201ENST00000366988 SYNJ1O43426 1573 aa35.52■■■■□ 3.28
NENF-201ENST00000366988 CHD1O14646 1710 aa35.49■■■■□ 3.27
NENF-201ENST00000366988 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.47■■■■□ 3.27
NENF-201ENST00000366988 GRIN2BQ13224 1484 aa35.42■■■■□ 3.26
NENF-201ENST00000366988 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.42■■■■□ 3.26
NENF-201ENST00000366988 PBRM1Q86U86 1689 aa35.4■■■■□ 3.26
NENF-201ENST00000366988 FBLN2P98095 1184 aa35.39■■■■□ 3.26
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NENF-201ENST00000366988 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.38■■■■□ 3.25
NENF-201ENST00000366988 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
NENF-201ENST00000366988 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
NENF-201ENST00000366988 SYNJ2O15056 1496 aa35.22■■■■□ 3.23
NENF-201ENST00000366988 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.17■■■■□ 3.22
NENF-201ENST00000366988 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.17■■■■□ 3.22
NENF-201ENST00000366988 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.17■■■■□ 3.22
NENF-201ENST00000366988 TRIM41Q8WV44 630 aa35.14■■■■□ 3.22
NENF-201ENST00000366988 ARHGEF11O15085 1522 aa35.11■■■■□ 3.21
NENF-201ENST00000366988 ADAMTS12P58397 1594 aa35.07■■■■□ 3.2
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NENF-201ENST00000366988 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.04■■■■□ 3.2
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NENF-201ENST00000366988 GRIN2AQ12879 1464 aa34.97■■■■□ 3.19
NENF-201ENST00000366988 KIF27Q86VH2 1401 aa34.87■■■■□ 3.17
NENF-201ENST00000366988 CEP170Q5SW79 1584 aa34.81■■■■□ 3.16
NENF-201ENST00000366988 NUP160Q12769 1436 aa34.8■■■■□ 3.16
NENF-201ENST00000366988 ARAP1Q96P48 1450 aa34.79■■■■□ 3.16
NENF-201ENST00000366988 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.78■■■■□ 3.16
NENF-201ENST00000366988 CUL7Q14999 1698 aa34.73■■■■□ 3.15
NENF-201ENST00000366988 IGF1RP08069 1367 aa34.7■■■■□ 3.15
NENF-201ENST00000366988 SHROOM2Q13796 1616 aa34.6■■■■□ 3.13
NENF-201ENST00000366988 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.55■■■■□ 3.12
NENF-201ENST00000366988 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.53■■■■□ 3.12
NENF-201ENST00000366988 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.52■■■■□ 3.12
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