RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.47■■■■■ 5.51
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CLDN3-201ENST00000395145 NACADO15069 1562 aa41.29■■■■■ 4.2
CLDN3-201ENST00000395145 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.28■■■■■ 4.2
CLDN3-201ENST00000395145 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
CLDN3-201ENST00000395145 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.13■■■■■ 4.18
CLDN3-201ENST00000395145 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.11■■■■■ 4.17
CLDN3-201ENST00000395145 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.99■■■■■ 4.15
CLDN3-201ENST00000395145 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.37■■■■■ 4.05
CLDN3-201ENST00000395145 SCRIBQ14160 1630 aa40.05■■■■■ 4
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CLDN3-201ENST00000395145 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.75■■■■□ 3.79
CLDN3-201ENST00000395145 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.49■■■■□ 3.75
CLDN3-201ENST00000395145 SMARCA4P51532 1647 aa38.37■■■■□ 3.73
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CLDN3-201ENST00000395145 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.11■■■■□ 3.69
CLDN3-201ENST00000395145 SMARCA2P51531 1590 aa38.09■■■■□ 3.69
CLDN3-201ENST00000395145 NCAPD3P42695 1498 aa38.09■■■■□ 3.69
CLDN3-201ENST00000395145 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.03■■■■□ 3.68
CLDN3-201ENST00000395145 HMGXB3Q12766 1538 aa37.93■■■■□ 3.66
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CLDN3-201ENST00000395145 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.06■■■■□ 3.52
CLDN3-201ENST00000395145 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.96■■■■□ 3.51
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CLDN3-201ENST00000395145 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.78■■■■□ 3.48
CLDN3-201ENST00000395145 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
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CLDN3-201ENST00000395145 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.53■■■■□ 3.44
CLDN3-201ENST00000395145 CUX2O14529 1486 aa36.5■■■■□ 3.43
CLDN3-201ENST00000395145 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.47■■■■□ 3.43
CLDN3-201ENST00000395145 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.4■■■■□ 3.42
CLDN3-201ENST00000395145 WDR62O43379 1518 aa36.3■■■■□ 3.4
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CLDN3-201ENST00000395145 ABCC8Q09428 1581 aa35.99■■■■□ 3.35
CLDN3-201ENST00000395145 TOPBP1Q92547 1522 aa35.97■■■■□ 3.35
CLDN3-201ENST00000395145 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.95■■■■□ 3.35
CLDN3-201ENST00000395145 CUX1P39880 1505 aa35.75■■■■□ 3.31
CLDN3-201ENST00000395145 IFT140Q96RY7 1462 aa35.72■■■■□ 3.31
CLDN3-201ENST00000395145 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
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CLDN3-201ENST00000395145 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.56■■■■□ 3.28
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CLDN3-201ENST00000395145 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.5■■■■□ 3.27
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CLDN3-201ENST00000395145 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.48■■■■□ 3.27
CLDN3-201ENST00000395145 SYNJ1O43426 1573 aa35.47■■■■□ 3.27
CLDN3-201ENST00000395145 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
CLDN3-201ENST00000395145 WDR97A6NE52 1622 aa35.36■■■■□ 3.25
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CLDN3-201ENST00000395145 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.29■■■■□ 3.24
CLDN3-201ENST00000395145 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
CLDN3-201ENST00000395145 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.15■■■■□ 3.22
CLDN3-201ENST00000395145 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.11■■■■□ 3.21
CLDN3-201ENST00000395145 GRIN2BQ13224 1484 aa35.09■■■■□ 3.21
CLDN3-201ENST00000395145 PBRM1Q86U86 1689 aa35.06■■■■□ 3.2
CLDN3-201ENST00000395145 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.02■■■■□ 3.2
CLDN3-201ENST00000395145 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
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CLDN3-201ENST00000395145 CHD1O14646 1710 aa34.94■■■■□ 3.18
CLDN3-201ENST00000395145 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.87■■■■□ 3.17
CLDN3-201ENST00000395145 SYNJ2O15056 1496 aa34.86■■■■□ 3.17
CLDN3-201ENST00000395145 FBLN2P98095 1184 aa34.8■■■■□ 3.16
CLDN3-201ENST00000395145 KIF27Q86VH2 1401 aa34.8■■■■□ 3.16
CLDN3-201ENST00000395145 ADAMTS12P58397 1594 aa34.79■■■■□ 3.16
CLDN3-201ENST00000395145 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
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CLDN3-201ENST00000395145 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.72■■■■□ 3.15
CLDN3-201ENST00000395145 IGF1RP08069 1367 aa34.65■■■■□ 3.14
CLDN3-201ENST00000395145 GRIN2AQ12879 1464 aa34.65■■■■□ 3.14
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CLDN3-201ENST00000395145 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.44■■■■□ 3.1
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CLDN3-201ENST00000395145 ARHGEF11O15085 1522 aa34.42■■■■□ 3.1
CLDN3-201ENST00000395145 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.41■■■■□ 3.1
CLDN3-201ENST00000395145 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.41■■■■□ 3.1
CLDN3-201ENST00000395145 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.41■■■■□ 3.1
CLDN3-201ENST00000395145 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.27■■■■□ 3.08
CLDN3-201ENST00000395145 SHROOM2Q13796 1616 aa34.26■■■■□ 3.07
CLDN3-201ENST00000395145 EEA1Q15075 1411 aa34.25■■■■□ 3.07
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