Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms