RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558085.6

TPTEP1-205, Transcript of TPTE pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TPTEP1, Length 1,738 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP1-205ENST00000558085 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.95■■■■■ 5.11
TPTEP1-205ENST00000558085 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.12■■■■■ 4.17
TPTEP1-205ENST00000558085 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
TPTEP1-205ENST00000558085 ABCC9O60706 1549 aa38.94■■■■□ 3.82
TPTEP1-205ENST00000558085 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.89■■■■□ 3.82
TPTEP1-205ENST00000558085 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.7■■■■□ 3.79
TPTEP1-205ENST00000558085 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.54■■■■□ 3.76
TPTEP1-205ENST00000558085 NACADO15069 1562 aa38.33■■■■□ 3.73
TPTEP1-205ENST00000558085 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.04■■■■□ 3.68
TPTEP1-205ENST00000558085 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.98■■■■□ 3.67
TPTEP1-205ENST00000558085 SCRIBQ14160 1630 aa37.67■■■■□ 3.62
TPTEP1-205ENST00000558085 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.22■■■■□ 3.55
TPTEP1-205ENST00000558085 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.86■■■■□ 3.49
TPTEP1-205ENST00000558085 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
TPTEP1-205ENST00000558085 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.64■■■■□ 3.46
TPTEP1-205ENST00000558085 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.44■■■■□ 3.42
TPTEP1-205ENST00000558085 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
TPTEP1-205ENST00000558085 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
TPTEP1-205ENST00000558085 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.23■■■■□ 3.39
TPTEP1-205ENST00000558085 SMARCA4P51532 1647 aa36.15■■■■□ 3.38
TPTEP1-205ENST00000558085 WIZO95785 1651 aa35.91■■■■□ 3.34
TPTEP1-205ENST00000558085 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
TPTEP1-205ENST00000558085 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.75■■■■□ 3.31
TPTEP1-205ENST00000558085 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.69■■■■□ 3.3
TPTEP1-205ENST00000558085 SMARCA2P51531 1590 aa35.61■■■■□ 3.29
TPTEP1-205ENST00000558085 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
TPTEP1-205ENST00000558085 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.59■■■■□ 3.29
TPTEP1-205ENST00000558085 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.48■■■■□ 3.27
TPTEP1-205ENST00000558085 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
TPTEP1-205ENST00000558085 NCAPD3P42695 1498 aa35.36■■■■□ 3.25
TPTEP1-205ENST00000558085 HMGXB3Q12766 1538 aa35.3■■■■□ 3.24
TPTEP1-205ENST00000558085 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.28■■■■□ 3.24
TPTEP1-205ENST00000558085 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.18■■■■□ 3.22
TPTEP1-205ENST00000558085 TRIM41Q8WV44 630 aa34.71■■■■□ 3.15
TPTEP1-205ENST00000558085 CFTRP13569 1480 aa34.49■■■■□ 3.11
TPTEP1-205ENST00000558085 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.41■■■■□ 3.1
TPTEP1-205ENST00000558085 PRDM2Q13029 1718 aa34.35■■■■□ 3.09
TPTEP1-205ENST00000558085 ABCC8Q09428 1581 aa34.33■■■■□ 3.09
TPTEP1-205ENST00000558085 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.24■■■■□ 3.07
TPTEP1-205ENST00000558085 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.2■■■■□ 3.07
TPTEP1-205ENST00000558085 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.066e-7■□□□□ 11.1
TPTEP1-205ENST00000558085 NESP48681 1621 aa34.11■■■■□ 3.05
TPTEP1-205ENST00000558085 SYNJ1O43426 1573 aa34.05■■■■□ 3.04
TPTEP1-205ENST00000558085 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.02■■■■□ 3.04
TPTEP1-205ENST00000558085 TOP2BQ02880 1626 aa33.97■■■■□ 3.03
TPTEP1-205ENST00000558085 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.96■■■■□ 3.03
TPTEP1-205ENST00000558085 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.92■■■■□ 3.02
TPTEP1-205ENST00000558085 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
TPTEP1-205ENST00000558085 EEA1Q15075 1411 aa33.91■■■■□ 3.02
TPTEP1-205ENST00000558085 CUX1P39880 1505 aa33.9■■■■□ 3.02
TPTEP1-205ENST00000558085 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.84■■■■□ 3.01
TPTEP1-205ENST00000558085 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.75■■■□□ 2.99
TPTEP1-205ENST00000558085 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.71■■■□□ 2.99
TPTEP1-205ENST00000558085 SOGA1O94964 1423 aa33.64■■■□□ 2.98
TPTEP1-205ENST00000558085 TOPBP1Q92547 1522 aa33.63■■■□□ 2.97
TPTEP1-205ENST00000558085 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
TPTEP1-205ENST00000558085 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.56■■■□□ 2.96
TPTEP1-205ENST00000558085 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.53■■■□□ 2.96
TPTEP1-205ENST00000558085 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.51■■■□□ 2.96
TPTEP1-205ENST00000558085 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.5■■■□□ 2.95
TPTEP1-205ENST00000558085 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
TPTEP1-205ENST00000558085 ERCC6Q03468 1493 aa33.44■■■□□ 2.94
TPTEP1-205ENST00000558085 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
TPTEP1-205ENST00000558085 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.42■■■□□ 2.94
TPTEP1-205ENST00000558085 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.41■■■□□ 2.94
TPTEP1-205ENST00000558085 KIF27Q86VH2 1401 aa33.36■■■□□ 2.93
TPTEP1-205ENST00000558085 GOLGA3Q08378 1498 aa33.36■■■□□ 2.93
TPTEP1-205ENST00000558085 WDR62O43379 1518 aa33.35■■■□□ 2.93
TPTEP1-205ENST00000558085 KIF21BO75037 1637 aa33.32■■■□□ 2.93
TPTEP1-205ENST00000558085 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.3■■■□□ 2.92
TPTEP1-205ENST00000558085 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.3■■■□□ 2.92
TPTEP1-205ENST00000558085 CUX2O14529 1486 aa33.29■■■□□ 2.92
TPTEP1-205ENST00000558085 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.29■■■□□ 2.92
TPTEP1-205ENST00000558085 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
TPTEP1-205ENST00000558085 WDR97A6NE52 1622 aa33.22■■■□□ 2.91
TPTEP1-205ENST00000558085 CEP162Q5TB80 1403 aa33.19■■■□□ 2.9
TPTEP1-205ENST00000558085 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
TPTEP1-205ENST00000558085 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
TPTEP1-205ENST00000558085 HRCP23327 699 aa33.1■■■□□ 2.89
TPTEP1-205ENST00000558085 PRXQ9BXM0 1461 aa33.08■■■□□ 2.89
TPTEP1-205ENST00000558085 IFT140Q96RY7 1462 aa33.07■■■□□ 2.88
TPTEP1-205ENST00000558085 IGF1RP08069 1367 aa33.06■■■□□ 2.88
TPTEP1-205ENST00000558085 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.05■■■□□ 2.88
TPTEP1-205ENST00000558085 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.02■■■□□ 2.88
TPTEP1-205ENST00000558085 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.98■■■□□ 2.87
TPTEP1-205ENST00000558085 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
TPTEP1-205ENST00000558085 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.97■■■□□ 2.87
TPTEP1-205ENST00000558085 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.9■■■□□ 2.86
TPTEP1-205ENST00000558085 CUL7Q14999 1698 aa32.89■■■□□ 2.86
TPTEP1-205ENST00000558085 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
TPTEP1-205ENST00000558085 PBRM1Q86U86 1689 aa32.82■■■□□ 2.84
TPTEP1-205ENST00000558085 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.81■■■□□ 2.849e-7■■■■□ 20
TPTEP1-205ENST00000558085 CLIP1P30622 1438 aa32.8■■■□□ 2.84
TPTEP1-205ENST00000558085 GRIN2BQ13224 1484 aa32.76■■■□□ 2.84
TPTEP1-205ENST00000558085 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
TPTEP1-205ENST00000558085 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.64■■■□□ 2.82
TPTEP1-205ENST00000558085 ADAMTS12P58397 1594 aa32.63■■■□□ 2.81
TPTEP1-205ENST00000558085 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.63■■■□□ 2.81
TPTEP1-205ENST00000558085 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.61■■■□□ 2.81
TPTEP1-205ENST00000558085 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.81
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