RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276603.9

TERF1-202, Transcript of telomeric repeat binding factor 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene TERF1, Length 1,677 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TERF1-202ENST00000276603 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.78■■■■■ 5.4
TERF1-202ENST00000276603 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.61■■■■■ 4.41
TERF1-202ENST00000276603 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
TERF1-202ENST00000276603 ABCC9O60706 1549 aa40.55■■■■■ 4.08
TERF1-202ENST00000276603 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.31■■■■■ 4.04
TERF1-202ENST00000276603 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.31■■■■■ 4.04
TERF1-202ENST00000276603 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.93■■■■□ 3.98
TERF1-202ENST00000276603 NACADO15069 1562 aa39.75■■■■□ 3.95
TERF1-202ENST00000276603 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.58■■■■□ 3.93
TERF1-202ENST00000276603 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.44■■■■□ 3.9
TERF1-202ENST00000276603 SCRIBQ14160 1630 aa39.16■■■■□ 3.86
TERF1-202ENST00000276603 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.75■■■■□ 3.79
TERF1-202ENST00000276603 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.39■■■■□ 3.74
TERF1-202ENST00000276603 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.22■■■■□ 3.71
TERF1-202ENST00000276603 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.97■■■■□ 3.67
TERF1-202ENST00000276603 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
TERF1-202ENST00000276603 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
TERF1-202ENST00000276603 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.71■■■■□ 3.63
TERF1-202ENST00000276603 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
TERF1-202ENST00000276603 SMARCA4P51532 1647 aa37.54■■■■□ 3.6
TERF1-202ENST00000276603 WIZO95785 1651 aa37.38■■■■□ 3.57
TERF1-202ENST00000276603 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
TERF1-202ENST00000276603 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.11■■■■□ 3.53
TERF1-202ENST00000276603 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37■■■■□ 3.51
TERF1-202ENST00000276603 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
TERF1-202ENST00000276603 SMARCA2P51531 1590 aa36.91■■■■□ 3.5
TERF1-202ENST00000276603 NCAPD3P42695 1498 aa36.73■■■■□ 3.47
TERF1-202ENST00000276603 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
TERF1-202ENST00000276603 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.7■■■■□ 3.47
TERF1-202ENST00000276603 HMGXB3Q12766 1538 aa36.61■■■■□ 3.45
TERF1-202ENST00000276603 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.6■■■■□ 3.45
TERF1-202ENST00000276603 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.25■■■■□ 3.39
TERF1-202ENST00000276603 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.13■■■■□ 3.37
TERF1-202ENST00000276603 CFTRP13569 1480 aa35.84■■■■□ 3.33
TERF1-202ENST00000276603 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.75■■■■□ 3.31
TERF1-202ENST00000276603 ABCC8Q09428 1581 aa35.73■■■■□ 3.31
TERF1-202ENST00000276603 TRIM41Q8WV44 630 aa35.68■■■■□ 3.3
TERF1-202ENST00000276603 PRDM2Q13029 1718 aa35.6■■■■□ 3.29
TERF1-202ENST00000276603 NESP48681 1621 aa35.57■■■■□ 3.28
TERF1-202ENST00000276603 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.48■■■■□ 3.27
TERF1-202ENST00000276603 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.47■■■■□ 3.27
TERF1-202ENST00000276603 SYNJ1O43426 1573 aa35.41■■■■□ 3.26
TERF1-202ENST00000276603 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.33■■■■□ 3.25
TERF1-202ENST00000276603 CUX1P39880 1505 aa35.26■■■■□ 3.23
TERF1-202ENST00000276603 TOP2BQ02880 1626 aa35.26■■■■□ 3.23
TERF1-202ENST00000276603 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.23■■■■□ 3.23
TERF1-202ENST00000276603 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.18■■■■□ 3.22
TERF1-202ENST00000276603 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.11■■■■□ 3.21
TERF1-202ENST00000276603 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.1■■■■□ 3.21
TERF1-202ENST00000276603 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
TERF1-202ENST00000276603 SOGA1O94964 1423 aa35.03■■■■□ 3.2
TERF1-202ENST00000276603 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.97■■■■□ 3.19
TERF1-202ENST00000276603 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
TERF1-202ENST00000276603 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.95■■■■□ 3.19
TERF1-202ENST00000276603 TOPBP1Q92547 1522 aa34.95■■■■□ 3.19
TERF1-202ENST00000276603 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.88■■■■□ 3.17
TERF1-202ENST00000276603 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.88■■■■□ 3.17
TERF1-202ENST00000276603 EEA1Q15075 1411 aa34.78■■■■□ 3.16
TERF1-202ENST00000276603 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.77■■■■□ 3.16
TERF1-202ENST00000276603 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
TERF1-202ENST00000276603 ERCC6Q03468 1493 aa34.71■■■■□ 3.15
TERF1-202ENST00000276603 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.7■■■■□ 3.14
TERF1-202ENST00000276603 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.67■■■■□ 3.14
TERF1-202ENST00000276603 WDR62O43379 1518 aa34.63■■■■□ 3.13
TERF1-202ENST00000276603 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
TERF1-202ENST00000276603 KIF27Q86VH2 1401 aa34.59■■■■□ 3.13
TERF1-202ENST00000276603 CUX2O14529 1486 aa34.58■■■■□ 3.13
TERF1-202ENST00000276603 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.56■■■■□ 3.12
TERF1-202ENST00000276603 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.54■■■■□ 3.12
TERF1-202ENST00000276603 WDR97A6NE52 1622 aa34.5■■■■□ 3.11
TERF1-202ENST00000276603 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
TERF1-202ENST00000276603 KIF21BO75037 1637 aa34.41■■■■□ 3.1
TERF1-202ENST00000276603 IGF1RP08069 1367 aa34.4■■■■□ 3.1
TERF1-202ENST00000276603 PRXQ9BXM0 1461 aa34.37■■■■□ 3.09
TERF1-202ENST00000276603 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
TERF1-202ENST00000276603 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.32■■■■□ 3.09
TERF1-202ENST00000276603 GOLGA3Q08378 1498 aa34.32■■■■□ 3.08
TERF1-202ENST00000276603 IFT140Q96RY7 1462 aa34.3■■■■□ 3.08
TERF1-202ENST00000276603 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.3■■■■□ 3.08
TERF1-202ENST00000276603 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.23■■■■□ 3.07
TERF1-202ENST00000276603 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.21■■■■□ 3.07
TERF1-202ENST00000276603 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.2■■■■□ 3.07
TERF1-202ENST00000276603 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
TERF1-202ENST00000276603 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.064e-6■■■■■ 31
TERF1-202ENST00000276603 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
TERF1-202ENST00000276603 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.16■■■■□ 3.06
TERF1-202ENST00000276603 CUL7Q14999 1698 aa34.06■■■■□ 3.04
TERF1-202ENST00000276603 PBRM1Q86U86 1689 aa34.06■■■■□ 3.04
TERF1-202ENST00000276603 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
TERF1-202ENST00000276603 GRIN2BQ13224 1484 aa33.99■■■■□ 3.03
TERF1-202ENST00000276603 CEP162Q5TB80 1403 aa33.99■■■■□ 3.03
TERF1-202ENST00000276603 ADAMTS12P58397 1594 aa33.87■■■■□ 3.01
TERF1-202ENST00000276603 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.85■■■■□ 3.01
TERF1-202ENST00000276603 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.81■■■■□ 3
TERF1-202ENST00000276603 CLIP1P30622 1438 aa33.78■■■■□ 3
TERF1-202ENST00000276603 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
TERF1-202ENST00000276603 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
TERF1-202ENST00000276603 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.68■■■□□ 2.98
TERF1-202ENST00000276603 SYNJ2O15056 1496 aa33.62■■■□□ 2.97
TERF1-202ENST00000276603 GRIN2AQ12879 1464 aa33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms