Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPIRE1Q08AE8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms