Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.615e-7■□□□□ 9
SRSF7Q16629 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.382e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 CHD4-208ENST00000540960 892 ntTSL 57.11□□□□□ -1.272e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 CHD4-205ENST00000536301 107 ntTSL 34.07□□□□□ -1.762e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.236e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.936e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.766e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.696e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.556e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 317.87■□□□□ 0.456e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.426e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.317e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 UBE2Z-205ENST00000508468 573 ntTSL 316.78■□□□□ 0.286e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-221ENST00000633899 591 ntTSL 416.56■□□□□ 0.246e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.196e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-208ENST00000465149 5380 ntTSL 216.24■□□□□ 0.197e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.187e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.077e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.056e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.017e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-209ENST00000465589 571 ntTSL 315.02■□□□□ -07e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-207ENST00000520058 559 ntTSL 214.71□□□□□ -0.056e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.086e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-212ENST00000491370 584 ntTSL 414.34□□□□□ -0.117e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-212ENST00000522912 2047 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.126e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-215ENST00000482693 755 ntTSL 213.55□□□□□ -0.246e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-207ENST00000413951 623 ntTSL 213.34□□□□□ -0.276e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-208ENST00000432725 475 ntTSL 413.22□□□□□ -0.296e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.346e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-214ENST00000523851 458 ntTSL 312.85□□□□□ -0.356e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.366e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 512.66□□□□□ -0.386e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-209ENST00000520953 2172 ntTSL 512.42□□□□□ -0.426e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.436e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.467e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.526e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.526e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.566e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.626e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.86e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.856e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.896e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 MAPK13-205ENST00000490334 649 ntTSL 58.72□□□□□ -1.016e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZNF189-204ENST00000615466 2316 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.176e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-215ENST00000524111 4074 ntTSL 57.2□□□□□ -1.266e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.376e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 MAPK13-204ENST00000476951 499 ntTSL 35.22□□□□□ -1.576e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.66e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-210ENST00000521691 580 ntTSL 33.51□□□□□ -1.856e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 514.21□□□□□ -0.137e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 514□□□□□ -0.177e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 513.59□□□□□ -0.237e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.237e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.37e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.357e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 512.44□□□□□ -0.427e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.447e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 311.14□□□□□ -0.637e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 58.58□□□□□ -1.047e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-202ENST00000366525 2851 ntTSL 58.27□□□□□ -1.097e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 513.03□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 211.49□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.893e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.939e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 PNISR-207ENST00000478777 2422 ntTSL 27.9□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.159e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-206ENST00000487510 579 ntTSL 26.65□□□□□ -1.349e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.392e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-203ENST00000473260 482 ntTSL 26.25□□□□□ -1.419e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPA2B1-205ENST00000476233 1220 ntTSL 1 (best)5.54□□□□□ -1.522e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-205ENST00000479947 470 ntTSL 25.54□□□□□ -1.529e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 PNISR-206ENST00000476159 537 ntTSL 35.3□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 PNISR-203ENST00000460600 2178 ntTSL 24.44□□□□□ -1.72e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.819e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-204ENST00000477096 3677 ntTSL 1 (best)1.62□□□□□ -2.159e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZNF638-222ENST00000491843 332 ntTSL 35.89□□□□□ -1.473e-8■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.557e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-204ENST00000311420 1583 ntTSL 58.77□□□□□ -1.017e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.37e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-222ENST00000523991 505 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.337e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-220ENST00000496959 897 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.357e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-212ENST00000393416 754 ntTSL 56.2□□□□□ -1.427e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-213ENST00000393417 1683 ntTSL 55.87□□□□□ -1.477e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-230ENST00000543323 427 ntTSL 1 (best)5.31□□□□□ -1.567e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-225ENST00000539479 845 ntTSL 1 (best)5.2□□□□□ -1.587e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.597e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-228ENST00000542502 1127 ntTSL 1 (best)4.92□□□□□ -1.627e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-224ENST00000537182 1011 ntTSL 1 (best)4.84□□□□□ -1.637e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-211ENST00000393415 842 ntTSL 54.72□□□□□ -1.657e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.667e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.687e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.737e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-226ENST00000540352 1315 ntTSL 1 (best)4.22□□□□□ -1.737e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-218ENST00000481186 1056 ntTSL 54.18□□□□□ -1.747e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-223ENST00000536089 1181 ntTSL 1 (best)4.18□□□□□ -1.747e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-234ENST00000546048 363 ntTSL 53.92□□□□□ -1.787e-7■□□□□ 8.8
Retrieved 100 of 5,030 protein–RNA pairs in 326 ms